西藏地处泛北极区系和古热带区系的交汇处，独特的自然地理位置和复杂多样的气候条件，孕育了丰富的植物资源，甚至第四纪冰川期遗留下来的一些植物，在藏东南雅鲁藏布大峡谷地区也有保存，堪称世界少有的“绿色基因库”和“自然博物馆”。全区共有高等植物6600多种、藻类植物2376种、真菌878种。在众多的野生植物资源中，有木本植物1700余种，药用植物1000余种，油脂、油料植物100余种，芳香油、香料植物180余种，工业原料植物（含鞣质、树脂、树胶、纤维植物）300余种，食用、饲用淀粉植物、野生林果植物300余种，园林绿化和观赏花卉植物达2000余种。食用菌415种，灵芝等药用菌238种，其中丝膜菌、虫草等已知有抗癌作用的真菌168种。

　　受国家重点保护的珍稀植物有38种（其中国家一级保护植物有喜玛拉雅红豆杉、玉龙蕨等6种），列入自治区重点保护植物有四叶红景天、亚东冷杉等40种，另有214种被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录内。